平成22年度補助金に対する北海道の財政援助団体等監査では、財団法人に対し、以下のような指摘がなされています。(平成23年度実施監査)
・間接補助金についての事例
(旧財団法人A→現公益財団法人A)
補助金が補助事業者である団体から更に間接補助金等となって間接補助事業者に給
付される場合については、その事業は、間接補助金等を交付することそのものである
ため、間接補助事業者に対する支払を完了することが補助事業の完了となるが、年度
内に間接補助金の支払を完了していないにもかかわらず、年度内に事業が完了したと
していた。