平成25～24年度補助金に対する徳島県の財政援助団体等監査では、公益財団法人に対し、以下のような指摘事項等がなされています。

（平成26年度実施監査）

・公益財団法人A

（指摘事項）

会計処理において、公益法人会計基準に基づき行われていないものがある。今後組織の見直し、研修の充実を図り、早急に適正な処理ができる体制を整える必要がある。

（平成25年度実施監査）

・公益財団法人B

（指摘事項）

割賦販売設備債権、リース設備債権及び設備資金貸付金で１年以上未収のものがある。回収の努力はうかがえるが、なお一層の収入確保に努める必要がある。