平成24年度補助金に対する滋賀県の財政援助団体等監査（平成25年度実施監査）では、公益財団法人に対し、以下のような指摘事項等がなされています。

・公益財団法人A

（指摘事項）

振興補助金において、補助対象経費の積算を誤っていたため、1,532円の過大交付を受けている事例が認められたので、速やかに補助金の返還手続きを講じるとともに、今後は適正な事務の執行に努められたい。