平成24年度補助金に対する群馬県の財政援助団体等監査（平成25年度実施監査）では、公益財団法人に対し、以下のような指摘等がなされています。
・公益財団法人A
（指摘事項）
所得税法第１８３条で、給与等の支払をする者はその支払の際、その給与等について所得税を徴収することとされている。徴収すべき所得税の額は、賞与以外の給与等については同 法第１８５条により同法別表第二に掲げる税額と、賞与については同法第１８６条により同法別表第四に掲げる税率を賞与額に乗じた税額とそれぞれ定められている。当該団体では、給与等及び賞与を支払う際に、所得税法の規定による税額を誤って徴収したため、平成２３年４月から平成２５年８月までの間、所得税を２４２，７８６円、過大に徴収していた。
平成28年度～27年度補助金に対する群馬県の財政援助団体等監査では、公益財団法人、公益社団法人に対し、以下のような指摘等がなされています。
（平成29年度実施監査）
・公益財団法人A
（注意事項）
当該団体は、平成２８年度購入契約（単価契約）を業者と締結し、１キログラム当たりの単価を定めた。 当該契約に係る支出において、当該団体は、契約単価と異なる単価で算出された請求書を収受し支払ったため、支払額が計２３，３２８円過大となった。
（平成28年度実施監査）
・公益社団法人B
（指摘事項）
当該団体は、平成２７年度に、群馬県補助金交付要綱に基づき、群馬県から看護実習シミュレーター等の設備整備費に係る補助金の交付を受けたが、補助対象経費の中に補助対象外経費である平成２７年２月に納品された設備整備費が含まれていたこと及び交付申請時の参考見積額が実績額として報告されていたことから、１４１，０００円の補助金が過大に交付されていた。
平成28年度補助金に対する茨城県の財政援助団体等監査(平成29年度実施監査)では、公益社団法人に対し、以下のような注意がなされています。
・公益社団法人A
「注意事項」
茨城県の推進業務委託において，予定価格を設定せず，かつ見積書を徴取しないまま，契約を締結したこと，また封書による予定価格表を作成しなかったことは適切でない。
平成23年度補助金に対する福島県の財政援助団体等監査(平成24年度実施監査)では、公益財団法人に対し、以下のような指摘がなされています。
・公益財団法人A
「指摘事項」会計処理について、著しく適性を欠いたものがある。次のとおり、協会会計規程に則った適正な会計処理が行われておらず、また、内部牽制体制が不完全なため適切なチェックも行われていない。
①利付国債券の3月分の利息550,000円について、平成23年度の収益とすべきだったにもかかわらず、年度末の預金通帳の記帳確認を怠ったために、平成24年度の収益としている。
②総勘定元帳と現金出納帳の差異161,522円について、現金出納帳の誤記帳を訂正すべきところ、当該誤記帳に基づき雑損失として誤って計上している。
③什器備品である陳列棚2件2,283,730円の取得に当たり、契約書が省略できる場合に該当していないにもかかわらず契約書を作成しておらず、また什器備品台帳も整備されていない。
平成24年度補助金に対する福島県の財政援助団体等監査(平成25年度実施監査)では、公益財団法人に対し、以下のような指摘がなされています。
・公益財団法人A
「指摘事項」
事務手続きが適性を欠いていることに加え、内部牽制が機能していないため、現金・預金の管理を始め、事務処理執行に著しく適性を欠いている。
①平成24年4月以降、支払業務を事実上財団の臨時事務局員B(以下「事務局員B」という)１名に任せている。
②一部の仕訳伝票が作成されておらず、主要帳簿である総勘定元帳も作成されていない。
③公益財団法人Aの会計規定で毎月末時点で行うこととされている預金残高と帳簿の称号がされていない。
④通帳と公印を同一の金庫に保管し、かつ同金庫の鍵の管理が不十分である上、本来事務局長自ら行うべき預金等払戻請求書への押印も事務局員Bに委ねており、事務局員Bが容易に預金の引き出しができる状態にあった。
⑤これらの結果、平成24年9月から平成25年6月までの間において、35件、1,223,866円の不正な預金の引き出し等が行われた。
平成25年度補助金に対する福島県の財政援助団体等監査（平成26年度実施監査）では、公益財団法人に対し、以下のような指摘がなされています
・公益財団法人A
「指摘事項」会計経理処理において、公益法人会計基準等に照らし著しく適性を欠いているものがある。
現金及び預金の有高が総勘定元帳の数値と一致していないなど、会計帳簿の整理に著しく適性を欠いているものがある。また、財務諸表と総勘定元帳の数値に整合性がない、あるいは、内訳が不明な勘定科目が正味財産増減計算書に計上されているなど、財務諸表の作成に著しく適性を欠いている。
・公益財団法人B
「指摘事項」法人の運営に、著しく適性を欠いているものがある。
当該法人の事業計画及び収支予算は、定款の定めにより毎年事業年度の開始の日の前日までに評議員会の承認を得なければならないが、平成26年度の事業計画及び収支予算を承認すべき評議員会が開催されてない。
平成26年度補助金に対する福島県の財政援助団体等監査(平成27年度実施監査)では、公益財団法人に対し、以下のような指摘がなされています。
・公益財団法人A
「指摘事項」会計経理処理において、公益法人会計基準に照らし著しく適性を欠いているものがある。
①平成26年度会計年度の決算内容について、理事会及び評議員会の承認後に伝票未作成等による計上漏れ等の誤りを発見したが、その修正を平成27会計年度で処理すべきところ、平成26会計年度として遡及して差替処理している。
②貸借対照表における勘定科目において、総勘定元帳の平成26会計年度の期首残高が平成25会計年度の期末残高と一致しないものがある。
③貸借対照表の一般正味財産と正味財産増減計算書の一般正味財産期末残高について一致すべきところ、一致してない。
平成25年度補助金に対する山形県の財政援助団体等監査（平成26年度実施監査）では、公益財団法人に対し、以下のような指摘がなされています。
・公益財団法人A
次のとおり是正又は改善を要する事項があったので、適切な措置を講じられたい。
（指摘事項）
ア、定款と諸規程の整合が図られていないものがあった。
イ、契約事務において、改善すべきものがあった。
(ア) 仕様書を精査していないものがあった。
(イ) 見積り合わせの方法が適切でないものがあった。
(ウ) 契約書に仕様書や別紙が添付されていないものがあった。
(エ) 仕様書で求める書類の提出を受けていないものや承認を行っていないものがあった。
(オ) 協議手続が行われていないものがあった。
平成24年度～23年度補助金に対する、秋田県の財政援助団体等監査では、公益財団法人、公益社団法人に対し、以下のような指摘がなされています。
平成２５年度
・公益社団法人A
（指摘事項）
新規参入円滑化等対策事業に係る未収金が新たに発生しているので、その回収及び今後の発生防止に努めること。また、家畜導入事業等に係る過年度未収金について、一部が回収されているものの、なお多額の残額があることから、その回収に一層努めること。
・公益財団法人B
（指摘事項）
機械類貸与事業等に係る未収金が新たに発生しているので、その回収及び今後の発生防止に努めること。また、過年度未収金について、一部が回収されているものの、なお多額の残額がある。
平成２４年度
・公益財団法人C
（指摘事項）
機械類貸与事業等に係る未収金の回収に一層努めること。
平成26年度～25年度補助金に対する秋田県の財政援助団体等監査では、公益財団法人、公益社団法人に対し、以下のような指摘がなされています。
（平成２７年度実施監査）
・公益財団法人A
（指摘事項）
正規の勤務時間を超えて勤務した職員に対して時間外勤務手当を支給しているが、時間外勤務時間に係る書類の整備が不十分である。
（平成２６年度実施監査）
・公益財団法人B
（指摘事項）
機械類貸与事業等に係る未収金が新たに発生しているので、その回収及び今後の発生防止に努めること。また、過年度未収金について、一部が回収されているものの、なお多額に上っている。
・公益社団法人C
（指摘事項）
（ア）家畜導入事業等に係る過年度未収金について、一部が回収されているものの、なお多額に上っている。
（イ）職員に対して法定労働時間を超える勤務を命じるにあたり、労働基準法第３６条第１項に規定する書面による協定の締結及び行政官庁への届け出を行っていない。